LOGIN
HESLO
^^^

Mgr. David Řeha, PhD.

Pozice

Vědecký pracovník
Adresa
Zámek 136, CZ-37333 Nové Hrady
Tel.: +420 389033801
reha@nh.cas.cz

Současné zaměření

Dosavadní výzkumná činnost je hlavě zaměřena na studium biomolekulárních systémů pomocí výpočetních metod. Jedná se jednak o výzkum interakcí biomolekul (proteinů, DNA) s různými ligandy pomocí MD simulací, QM/MM výpočtů a molekulárního dockování. Studium funkčních procesů u širokého spektra proteinů, včetně membránových proteinů, pomocí MD simulací. Dále pak studium mechanismů enzymatických reakcí pomocí QM/MM výpočtů a modelování tranzitních stavů u enzymatických reakcí. Další oblastí je studium přenosu náboje (charge transfer) u biomolekul (DNA, fotosyntetické proteiny) a výpočet spektroskopických konstant (IR, NMR, UV) pomocí QM metod kombinovaných s MD simulacemi. V neposlední řadě se také zabývá vývojem a aplikací nových výpočetních metod (např. MM polarizace pro QM/MM výpočty).

Dřívější výsledky

  • 2009-2011 Postdoct: Department of Biological Sciences, University of Essex, Colchester, Velká Británie
    Projekt: Implementace MM polarizace v QM/MM výpočtech
    Vedoucí projektu: Prof. Christopher Reynolds
  •  

  • 2007-2009 Postdoc: School of Physics and Astronomy, University of Leeds, Velká Británie
    Projekt: Multi-škálový model přenosu náboje u DNA molekul
    Vedoucí projektu: Dr. Sarah Harris
  •  

  • 2005-2006 Postdoc: NCBR, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita, Brno, ČR
    Projekt: Ab initio výpočty NMR prametrů u DNA.
    Vedoucí projektu: Prof. Vladimír Sklenář
  •  

  • 2000-2005 Doktorské studium: Přírodovědecká Fakulta, Univerzita Karlova, Praha, ČR + Ústav Organické Chemie a Biochemie, Akademie věd České Republiky
    Obor studia: Fyzikální chemie
    Téma doktorské práce: „Ab Initio Calculations and Molecular Dynamics Simulations of Biomolecules in the Gas Phase and in Aqueous Solution.“
    Školitel: Prof. Pavel Hobza
  •  

  • 1995-2000 Magisterské studium: Přírodovědecka Fakulta, Univerzita Karlova, Praha, ČR
    Obor studia: Fyzikální chemie
    Téma diplomové práce: „Teoretické studium interakce interkalátorů s DNA“
    Školitel: Prof. Pavel Hobza

Publikace

publicationslist.org/david.reha

Ústavní publikace v impaktovaných časopisech